دکتر ریموند رخشانی
مقاله و فایل صوتی شصت و هفتم
با سلام، من ریموند رخشانی هستم و حوزه کارشناسی من مهندسی سیستم هاست، و تخصص علمی من در بکارگیری اندیشه سیستمی برای انتقال فن آوری مدرن و اجرا و پیاده سازی تولید فراورده های نوین می باشد.
در این سلسله از مقالات و فایل های صوتی، کوشش می کنم که علم مدرن را (به زبان فارسی) از پایه به دوستانی که علاقمند هستند، در حد توان، ارائه کنم. از اساتید، پژوهشگران و اندیشمندان عزیز، خواهشمندم که لینک ها را به دوستان و بویژه به جوانان دانش پژوه ما (که اغلب دسترسی نظام مند برای آشنایی با علم مدرن – به زبان فارسی – ندارند) ارسال فرمایند.
در قسمت پایانی فایل صوتی هم نقدی بر منش روشنفکر دینی، آقای عبدالکریم سروش، است.
لینک همه مقالات و فایلهای صوتی پیشین در پایان مقاله گذاشته شده است[۱]. دوستانی هم که در شبکه های اجتماعی حضور دارند، می توانند این مجموعه فایل های صوتی و مقالات “سرشت علم” را از ابتدا از طریق لینک تلگرام زیر با دوستان دیگر شریک شوند. با احترام، ر. رخشانی
(“https://t.me/natureofscience”)
مُهَندسی ژنتیک[۲]
هَرچه مُلکول زیست شناسان[۳] با الفبا و زبانِ ژن ها آشناتر می شوند[۴] بیشتر می آموزند[۵] تا چگونه هر ارگانیسمی را و نتیجتاً خودِ زندگی را با بکارگیریِ روش هایِ علمی و ابزارهایِ فنی[۶] تغییر[۷] دهند.
مهَندسیِ ژنتیک فرآیندِ تغییر آگاهانه ی ترتیبِ[۸] (یا ردیفِ[۹]) کدشده ی[۱۰] دی ان ای و آر اِن اِی[۱۱] هاست[۱۲].
- ملکول زیست شناسان[۱۳] مجموعه ی شگفت انگیزی از آنزیم هایی که دی اِن اِی ها را قطع، وصل، کپی و چیدمانی دیگر می کنند[۱۴] کشف کرده اند[۱۵] و با استفاده از ابزارهای مدرن و روش هایِ پیچیده ی شیمیایی متدهای ظریفِ مهندسی ژنتیک[۱۶] را پایه ریخته اند[۱۷].
- امروزه هر ترتیبی از نیوکلئوتیدها می تواند[۱۸] هم نهشته شده به درون هر سلولی[۱۹] معرفی شود[۲۰].
- از آن گذشته در سطحِ آزمایشی[۲۱]، حتی قطعه هایی[۲۲] از ترتیبِ دی اِن اِی[۲۳] برخی ارگانیسم ها[۲۴] برداشته شده است[۲۵].
- روش ها و جعبه ی ابزارهای ژنتیکی[۲۶] شامل روش هایی است که ارگانیسم هایِ متفاوت را برای شناسایی بیماری های[۲۷] موروثی[۲۸] دقیقا آزمایش می کند[۲۹] و راه هایِ تکاملِ ژنتیک[۳۰] را نقشه برداری می کند[۳۱] و در شناسایی مواردِ جنایی[۳۲] هم مورد استفاده است[۳۳].
نخستین تلاش های پژوهشی مهندسی ژنتیک[۳۴] در بکارگیری باکتری های تک سلولی برای تجدیدتولیدِ سریعی بود[۳۵] که در صنعت پزشکی برای تولیدِ انبوه[۳۶] پروتئین و همچنین در حوزه ی تولید انبوهِ موادِ غذایی انجام گرفت.[۳۷]
- در آن موارد برای نمونه سلول هایی باکتریایی[۳۸] در مجاورت و ارتباطِ با رشته های دی ان ای که ژن هایی هدفمند را مورد نظر داشتند قرار گرفتند[۳۹].
- نخستین موفقیت های مهندسی ژنتیک در بوجودآوری E.Coli بود که حاوی ژن هایی مصنوعی[۴۰] بود که برای تولید انسولین و همچنین برای تولیدِ هورمون های رشد استفاده شد[۴۱].
- در ابعادِ کوچک تر ساختنِ پروتئین ها دستآورد دیگری بود[۴۲].
- روش های مهندسی ژنتیک به شناسایی پروتئین های نقصان دار که عامدانه اشتباهاتی اسیدآمینه ای[۴۳] دارند کمک کرده است[۴۴].
معرفی ژن هایی هدفمند در ژنوم هر سلولی (که به منزله ی القای[۴۵] فرآیندِ هم نهشتیِ پروتئینی در سلولِ باکتریایی است[۴۶]) برای گیاهان هم استفاده شده است[۴۷].
- بکارگیری چنین روشی ژنتیک[۴۸] در سبزیجات، میوه ها و گیاهان که اصلاح گری ژنتیک[۴۹] نامیده می شود باعثِ رشدِ غددی گیاهی و باکتری هایی سمی در آنها می شود که در مقابلِ حشرات و آفات مقاوم اند[۵۰].
- سلول های انفرادیِ گیاهانی که در آن غدد رشد کرده اند تبدیل به گیاهانی مقاوم در مقابلِ آفاتِ نباتی می شوند[۵۱].
- دانشمندان و جنبش های مخالفِ اصلاح گریِ ژنتیک به فقدانِ پژوهش های کافی و لازم[۵۲] در موردِ پیامدهای ناخواسته ی[۵۳] درازمدتِ آن باکتری هایِ غددِ رشدی[۵۴] در سلول های آدمی اشاره دارند[۵۵].
با بکارگیریِ روش هایِ علمی و ابزارهایِ فنی[۵۶] آزمایش های ژنتیکِ این چنین هم اکنون برای افزایشِ تولیدِ کشاورزی و غذا[۵۷]، برای افزون کردنِ طولِ عمر سبزیجات و میوه ها در انبارها و برای جلوگیری از قحطی و آفاتِ گیاهی هر روزه در شرکت های خصوصی بدون کنترلِ دولتی[۵۸] انجام می شوند.[۵۹]
- بجز جنبه های نگران کننده ی تندرستی در این موادِ غذایی[۶۰]، مسایل خطرناکِ دیگری از قبیل استفاده ی این آزمایشات در خدمتِ تولیدِ ابزارهای بیولوژیکی[۶۱] تسلیحاتِ کشتارِ دستجمعی[۶۲] هم مطرح هستند.
- فن آوری هایی اینچنین بسادگی می توانند تولیدکننده ی ارگانیسم های سمی[۶۳] باشند[۶۴].
- معرفی اشکالِ نوینی از زندگی در محیطِ زیست هم از پیآمدهایِ ناخواسته ی چنین آزمایشاتِ بدون کنترل می باشد[۶۵].
اگرچه مهندسی ژنتیکِ[۶۶] جانوران[۶۷] بسیار مشکل تر از مهندسیِ ژنتیکِ میکروب ها و گیاهان[۶۸] است[۶۹] اما پیشرفت های بسیاری در این زمینه حاصل شده است. [۷۰]
- برخی دانشمندان صحبت از پایستگی یا حفظِ تنوع یا گوناگونیِ زیستی[۷۱] بویژه در موردِ جانورانِ در حالِ انقراض[۷۲] کرده اند[۷۳]. در مواردی هم حتی به جستجوی ژنوم حیواناتِ منقرض شده[۷۴] در کلاهک های یخی و یخ های کوه های سیبری[۷۵] نیز پرداخته اند تا بتوانند آنها را دوباره بوجود بیآورند[۷۶].
- در کشورهایی از قبیل آلمان[۷۷] حتی انبارهایِ موادِ ژنتیک از ژنومِ حیوانات در حالِ انقراض[۷۸] تاسیس شده است[۷۹].
ضروری ترین کاربردهای مهندسی ژنتیک[۸۰] تلاش های دانشمندان برای درمانِ بیماری های[۸۱] موروثی[۸۲] هستند[۸۳].
تا کنون بیش از سه هزار بیماری ژنتیکِ[۸۴] بشر شناخته[۸۵] شده اند.[۸۶]
- هر یک از بیماری ها بدلیلِ نقصانی ژنتیک[۸۷] است[۸۸] و هر کدام مستقلا موضوعِ پژوهش[۸۹] هستند[۹۰].
- در مواردی یک اشتباهِ کوچک[۹۱] در ترتیبِ نیوکلئوتیدهای[۹۲] ژنِ آدمی[۹۳] به نقصانی در نوعی پروتئین منجر می شود[۹۴].
- در موردِ بیماری هانتینگتون[۹۵] برای نمونه[۹۶] نقصان ژنتیک[۹۷] بدلیل ترتیبِ کودون C-A-G است[۹۸] که رشته های اسید آمینه ی طولانی گلوتامین[۹۹] را در پروتئین[۱۰۰] بوجود می آورد[۱۰۱].
- چالش اصلیِ[۱۰۲] پیشِ رویِ دانشمندان آن است که چگونه می توان[۱۰۳] نقصان های ژنتیک[۱۰۴] را برطرف کرد[۱۰۵].
نقدی بر منش
نقدی بر منش[۱۰۶] روشنفکر دینی[۱۰۷]، آقای عبدالکریم سروش[۱۰۸]
———————————-
https://www.linkedin.com/in/raymond-rakhshani-16628a5/detail/recent-activity/shares/
چاپ و انتشار این مقالات و فایل های صوتی بدون ذکر نام نویسنده (ر. رخشانی) و مرجع، و هرگونه استفاده برای مقاصد خصوصی و اهداف انتفاعی بدون گرفتن مجوز از نویسنده اکیدا غیر قانونی است.
molecular biologists
Pyeritz, Reed, E. and Korf, Bruce, R. and Grody, Wayne, W. Emery and Remoin’s Principles and Practice of Medical Genetics and Genomics: Foundations. Academic Press, 2018.
Capra, Fritjof, and Luisi, Pier Luigi. The Systems View of Life: A Unifying Vision. Cambridge University Press, 2016.
برای دریافت نیازهای ابزاری و شناخت ابعاد و مقیاس هایی که بدان ها پرداخته شده، نگاه کنید به:
http://htwins.net
Rakhshani, Raymond. Origins of Modernity. Even Development in the Evolution of Science and Technology. South Carolina: CreateSpace, A Division of Amazon Publishing, 2011.
Sandalov, Igor, and Padyukov, Leonid. Between the Lines of Genetic Code. Academic Press, 2013.
Genetic Engineering is concerned with the Conscious modification process of the distinct coded sequence of DNA and RNAs.
coded sequence
Darnell, James. RNA: Life’s Indispensable Molecule. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2011.
Watts, Henry. A Dictionary of Chemistry and the Allied Branches of Other Sciences. Forgotten Books, 2018.
Deamer, David, W. Assembling Life: How Can Life Begin on Earth and Other Habitable Planets? Oxford University Press, 2019.
Lane, Nick. The Vital Question: Energy, Evolution, and the Origins of Complex Life. W. W. Norton & Company, 2015.
Dardevet, Dominique. The Molecular Nutrition of Amino Acids and Proteins: A Volume in the Molecular Nutrition Series. Academic Press, 2016.
Scherman, Daniel. Advanced Textbook on Gene Transfer, Gene Therapy and Genetic Pharmacology: Principles, Delivery, and Pharmacological and Biomedical Applications of Nucleotide-Based Therapies. World Scientific Publication Corporation, 2019.
Nookaew, Intawat. Network Biology. Advances in Biochemical Engineering and Biotechnology. Springer, 2017.
Skwarecki, Beth. Genetics 101: from Chromosomes and the Double Helix to Cloning and DNA Tests, Everything You Need to Know about Genes. Adams Media, 2018.
Litwack, Gerald. Human Biochemistry. Academic Press, 2017.
Snedden, Robert. The Diversity of Life: From Single Cells to Multicellular Organisms. Heinemann, 2007.
Mertens, Thomas, L. and Hammersmith, Robert, L. Genetics Laboratory Investigations (14th Edition.) Pearson, 2014.
segments
DNA sequence
Plomin, Robert. Blueprint: How DNA Makes Us Who We Are. Penguin, 2019.
Ballarin, Loriano, and Cammarata, Matteo. Lessons in Immunity: From Single-cell Organisms to Mammals. Academic Press, 2016.
genetic toolkit
Anders, Mason. Heredity. Capstone Press, 2017.
Metzl, Jamie. Hacking Darwin: Genetic Engineering and the Future of Humanity. Sourcebooks, 2019.
McKissick, Katie. What’s in Your Genes? From the Color of Your Eyes to the Length of Your Life, A Revealing Look at Your Genetic Traits. Adams Media, 2014.
Wahlsten, Douglas. Genes, Brain Function, and Behavior: What Genes Do, How They Malfunction, and Ways to Repair Damage. Academic Press, 2019.
Reich, David. Who We Are and How We Got Here: Ancient DNA and the New Science of the Human Past. Vintage, 2019.
McKissick, Katie. What’s in Your Genes? From the Color of Your Eyes to the Length of Your Life, A Revealing Look at Your Genetic Traits. Adams Media, 2014.
Watson, James, and Berry, Andrew, and Davies, Kevin. DNA: The Story of the Genetic Revolution. Knopf, 2017.
Goodheart, Clyde, R. Life’s Code: How DNA Says Who We Are. Best eWay Publications Inc., 2019.
Ballarin, Loriano, and Cammarata, Matteo. Lessons in Immunity: From Single-cell Organisms to Mammals. Academic Press, 2016.
mass production
Berg, P. and Singer, M.F. Dealing with Genes: The Language of Heredity. Sausalito, CA: University Science Books, 1972.
https://drive.google.com/file/d/0Bw7EFXWJCSimYXoxenNZVm1TX00/view?ts=5844936e
Garber, Steven Daniel. Biology: A Self-Teaching Guide. Wiley, 2002.
synthetic genes for production of insulin and growth hormones
Strachan, Tom, and Read, Andrew. Human Molecular Genetics. Garland Science, 5th Edition, 2018.
Hershey, John, W. B. and Sonenberg, Nahum, and Matthews, Michael, B. Protein Synthesis and Translational Control. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012.
Defective Amino Acid Sequence
defective proteins with intentional amino acid mistakes
inducing
Cull, Jane. Living Systems: An Introductory Guide to the Theories of Humberto Maturana and Francisco Varela. Createspace Independent Publishing Company, 2013.
Liljas, Andres, and Ehrenberg, Mans. Structural Aspects of Protein Synthesis. World Scientific Publishing Corporation, 2013.
Mukherjee, Siddhartha. The Gene: An Intimate History. Scribner, 2016.
Genetically modified organisms (GMO)
genetic modification – plant tumorous growth and toxic bacteria
Arora, Ramesh, and Sandhu, Surinder. Breeding Insect Resistant Crops for Sustainable Agriculture. Springer, 2017.
Tagliafero, Linda. Genetic Engineering: Modern Progress or Future Peril? Twenty First Century Books, 2009.
unintended consequences
Mahgoub, Salah, E. O. Genetically Modified Foods: Basics, Applications, and Controversy. CRC Press, 2015.
Bourne, Henry, R. Paths to Innovation: Discovering Recombinant DNA, Oncogenes, and Prions, in one Medical School, over One Decade. University of California Press, 2011.
Walker, Sara Imari, and Davies, Paul, C. W. and Ellis, George, F. R. From Matter to Life: Information and Causality. Cambridge University Press, 2017.
Dubey, Suresh Kumar, and Pandey, Ashok, and Sangwan, Rajender Singh. Current Developments in Biotechnology and Bioengineering: Crop Modification, Nutrition, and Food Production. Elsevier, 2016.
Sandel, Michael, J. The Case Against Perfection: Ethics in the Age of Genetic Engineering. Belknap, Harvard University Press, 2009.
Trefil, J.S. and Hazen, R.M. The Sciences, An Integrated Approach, 2nd Edition. New York: Wiley, 1997.
Traitler, Helmut, and Dubois, Michel, and Heikes, Keith, and Petiard, Vincent, and Zilberman, David. Mega Trends in Food and Agriculture: Technology, Water Use, and Nutrition. Wiley, 2018.
Doudna, Jennifer, A. and Sternberg, Samuel, H. A Crack in Creation: Gene Editing and the Unthinkable Power to Control Evolution. Mariner Books, 2018.
Emery, Theo. Hellfire Boys: The Birth of the U.S. Chemical Warfare Service and the Race for the World’s Deadliest Weapons. Little, Brown and Company, 2017.
Cummins, Claire Hope. Uncertain Peril: Genetic Engineering and the Future of Seeds. Becun Press, 2008.
Krutzsch, Walter, and Myjer, Eric, and Trapp, Ralf. The Chemical Weapons Convention: A Commentary. Oxford University Press, 2014.
Thomas, Linda Carrick. Polonium in the Playhouse: The Manhattan Project’s Secret Chemistry Work in Dayton, Ohio. Trillium, 2017.
Rooney, Anne. Genetic Engineering and Developments in Biotechnology. Crabtree Publishing Company, 2016.
Burgan, Michael. Genetic Engineering: Science, Technology, Engineering (Calling All Innovators: A Career for You.) Children’s Press, 2016.
Isik, Fikret, and Holland, James, and Maltecca, Christian. Genetic Data Analysis for Plants and Animal Breeding. Springer, 2017.
Dawkins, Richard. The Selfish Gene. Oxford University Press, 2016.
Metzl, Jamie. Hacking Darwin: Genetic Engineering and the Future of Humanity. Sourcebooks, 2019.
biodiversity
Lovejoy, Thomas, E. and Hannah, Lee, and Wilson, Edward, O. Biodiversity and Climate Change: Transforming the Biosphere. Yale University Press, 2019.
Pahara, Justin, and Legault, Julie. Zero to Genetic Engineering Hero: The Beginners’ Guide to Programming Bacteria at Home, School, and the Makerspace. Justin Pahara Publishing, 2018.
Martin, Bridget. Survival or Extinction: How to Save Elephants and Rhinos. Springer, 2019.
Brockman, John. Know This: Today’s Most Interesting and Important Scientific Ideas, Discoveries, and Developments. Harper Perennial, 2017.
Hirsch, Rebecca, E. De-Extinction: The Science of Bringing Lost Species Back to Life. Twenty First Century Books, 2017.
Castle, Michael, J. Adeno- Associated Virus Vectors: Design and Delivery (Methods in Molecular Biology.) Humana, 2019.
Barrow, Jr. Mark, V. Nature’s Ghost: Confronting Extinction from the Age of Jefferson to the Age of Ecology. University of Chicago Press, 2015.
Hartwell, Leland, H. and Goldberg, Michael, L. and Fischer, Janice, A. and Hood, Leroy, and Aquadro, Charles, F. Genetics: From Genes to Genome, 5th Edition. McGraw- Hill Education, 2014.
Berg, P. and Singer, M.F. Dealing with Genes: The Language of Heredity. Sausalito, CA: University Science Books, 1972.
Pedro-Salvador, Abdulateef, and Pedro, Muhammad. Introduction to Genetic Inheritance: A Mathematical Model. Independently Published, 2018.
Coy, David. Acquired Traits. David Coy Publishers, 2012.
Carey, Nessa. The Epigenetics Revolution: How Modern Biology is Rewriting Our Understanding of Genetics, Disease, and Inheritance. Columbia University Press, 2013.
Templeton, Nancy Smyth. Gene and Cell Therapy: Therapeutic Mechanisms and Strategies. CRC Press, 2015.
Meneely, Philip. Genetics: Genes, Genomes, and Evolution. Oxford University Press Academic Books, 2017.
Dudley, W. Genetic Engineering, Opposing Viewpoints. San Diego, CA: Greenhaven Press, 1998.
Genetic defect
Lee, Know. Mitochondria and the Future of Medicine: The Key to Understanding Disease, Chronic Illnesses, Aging, and Life Itself. Chelsea Green Publishing, 2018.
Hartl, Daniel, L. and Cochrane, Bruce. Genetics: Analysis of Genes and Genomes. Jones & Bartlett Publishing, 2017.
Hildt, Elisabeth, and Graumann, Sigrid. Genetics in Human Reproduction. Routeledge, 2018.
Kay, Lily, E. Who Wrote the Book of Life? A History of Genetic Code.Stanford University Press, 2000.
nucleotide
Scherman, Daniel. Advanced Textbook on Gene Transfer, Gene Therapy and Genetic Pharmacology: Principles, Delivery, and Pharmacological and Biomedical Applications of Nucleotide-Based Therapies. World Scientific Publication Corporation, 2019.
Flatt, Thamas, and Heyland, Andreas. Mechanisms of Life History Evolution: The Genetics and Physiology of Life History Traits and Trade-Offs. Oxford University Press, 2011.
huntington disease
Bird, Thomas, D. Can You Help Me?: Inside the Turbulent World of Huntington Disease. Oxford University Press, 2019.
Pedro-Salvador, Abdulateef, and Pedro, Muhammad. Introduction to Genetic Inheritance: A Mathematical Model. Independently Published, 2018.
Atkins, John, F. and Gesteland, Raymond, F. Recoding: Expansion of Decoding Rules Enriches Gene Expression (Nucleic Acids and Molecular Biology Book 24.) Springer, 2010.
glutamine
Hughes, Andrew, B. Amino Acids, Peptides and Proteins in Organic Chemistry, Modified Amino Acids, Organocatalysis and Enzymes (Volume 2.) Wiley – VCH, 2009.
Gardner, McKinley, R. J., and Amor, David, J. Gardner and Sutherland’s Chromosome Abnormalities and Genetic Counseling. Oxford University Press, 2018.
Sandalov, Igor, and Padyukov, Leonid. Between the Lines of Genetic Code. Academic Press, 2013.
Rydzewski, Robert, M. Real World Drug Discovery: A Chemist’s Guide to Biotech and Pharmaceutical Research. Elsevier Science, 2010.
Ahmad Bhat, Tariq, and Ahmad Wani, Aijaz. Chromosome Structure and Aberrations. Springer, 2017.
Neiman, Susan. Evil in the Modern Thought: An Alternative History of philosophy. Princeton University Press, 2015.
https://www.youtube.com/watch?v=7MkCgNTd2Es
———————-
ر. رخشانی
«اولین روز باران[۱]»
در
اولین روز باران،
وقتی که
گیاهان تشنه،
مزارع خاکی بودند،
وقتی که
تنها سایه ی خورشید
بر ابرها می نشست،
وقتی که
قایق ها
آهسته به ساحل بازمی گشتند،
از باد خواستی
ترا با خود ببرد،
زیرا که
روح ات
غمگین تر از حس ات بود،
بادی که
با پیراهن و با دامن ات می رقصید.
نمی خواستی
بعضی چیزها را بشنوی.
می خواستی
فراموش کنی.
در اولین روز باران
دنیای ات
دنیای رویاها بود.
—————————–
Rakhshani, R. Selected Poems. Craetespace, An Amazon.com Company, 2014.
—————————